高通量测序及机器学习在水环境微生态领域的研究

基于高通量测序的水环境微生物生态宏基因组研究。实验室配备DellT7920, 16核CPU(2.1ghz),32线程,96G内存工作站,并搭建了完整的宏基因组分析流程,可以对Illumina平台下机原始测序数据完成数据清洗、序列拼接、基因预测、物种和功能注释等任务。基于宏基因组研究管网水与生物膜中抗性基因水平传播机理、抗性基因与可移动遗传原件共存机制,以及环境因子如消毒剂、消毒副产物等对抗生素抗性的影响。

此外,课题组在人工智能与水污染控制交叉领域展开深入研究,利用前沿信息技术机器学习(随机森林、支持向量机等)及深度学习算法(人工神经网络-遗传算法等)对生物测序数据、水处理厂运行维护参数等进行数据挖掘、预测模型建立,从而研究并实现水源水微生物污染溯源、水厂自动化运行等一系列实际应用。

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